内镜清洗消毒系统使用时需注意以下几点：

1. 在使用清洗消毒系统前，应确保所有内镜已经彻底清洗干净，包括镜面、活检孔、吸引器管道等。
2. 在进行清洗时，应使用合适的清洗消毒剂，按照规定的程序进行操作，确保内镜的彻底清洗和消毒。
3. 在使用清洗消毒系统时，应注意避免水汽、水滴等物质进入内镜的活检孔，以免引起感染。
4. 操作过程中，应避免用力过猛，以免损坏内镜或造成其他不良后果。
5. 在使用清洗消毒系统后，应注意保存好内镜及附件，避免污染和损坏。
6. 定期对清洗消毒系统进行检查和保养，确保其正常运行。
7. 定期对内镜及附件进行更换和清洗，以保持其清洁度和有效性。
8. 定期对内镜清洗消毒系统进行检测和校准，以确保其消毒效果符合标准。

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